在“营改增”政策实施之后，境内企业向非居民企业支付特许权使用费时，除了必须代扣代缴企业所得税之外，还须代扣代缴增值税、城建税和教育费附加等。
如果非居民企业提供的服务属于销售无形资产或现代服务业范畴，那么在对外支付的特许权使用费中，代扣代缴税款的增值税税率设定为6%。依据企业所得税法及实施条例的规定，对于支付给非居民企业的特许权使用费，其代扣代缴税款的企业所得税税率则定为10%。
