滞留发票的处理需要根据具体情况来确定。如果企业收到的发票是由对方开具给本公司的，而没有进行认证抵扣形成滞留，那么可以将该发票进行认证抵扣。具体的分录处理方式可以根据发票的内容计入相应的科目。
具体分录如下：
借：原材料等；
应交税费—应交增值税—进项税额；
贷：应付账款等。
