土地增值税补缴的会计处理：
一、开发公司等主营转让国有土地使用权、地上建筑物及其附着物的纳税人的会计分录为： 借：税金及附加 贷：应交税金—应交土地增值税 企业缴纳土地增值税的会计分录略，下同。
二、兼营房地产业务的纳税人的会计分录为： 借：其他业务支出， 贷：应交税金—应交土地增值税，
三、其他非主营、兼营房地产业务的纳税人，会计处理分两种情况： 如果房产未转让清理完毕， 借：固定资产清理或在建工程， 贷：应交税金—应交土地增值税， 如果转入清理的建筑物及其附着物清理完毕，“固定资产清理”科目余额已转入“营业外收入”或“营业外支出”科目 借：营业外支出或营业外收入， 贷：应交税金—应交土地增值税，
四、转让国有土地使用权的纳税人的会计分录为： 借：营业外支出或营业外收入， 贷：应交税金—应交土地增值税， 补缴以往年度的土地增值税，包括补缴按房地产转让收入预缴的土地增值税 借：以前年度损益调整， 贷：应交税金—应交土地增值税， 补缴的土地增值税对往年所得税的影响 借：应交税金—应交所得税， 贷：以前年度损益调整， 期末，将“以前年度损益调整”科目余额转入“利润分配—未分配利润”科目 借：利润分配—未分配利润， 贷：以前年度损益调整， 如果转入清理的建筑物及其附着物未清理完毕，“固定资产清理”科目仍有余额 借：固定资产清理或在建工程， 贷：应交税金—应交土地增值税， 缴纳相应的滞纳金和罚款， 借：营业外支出， 贷：银行存款。
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