当遇到发票金额与支票金额不相符的情况时,企业首要任务是验证发票金额的准确性。一旦确认发票数额无误,应主动与对方沟通,查明支票金额与发票金额差异的具体原因。根据不同的情境,采取相应的处理措施:若发票金额超出支票金额,则将差额部分记入应收账款;反之,若支票金额超过发票金额,则可将多余款项归类于预收账款进行管理。