差额征税的账务处理，企业在接受应税服务时，根据相关规定允许扣减销售额而减少的销项税额，应借记“应交税费——应交增值税(营改增抵减的销项税额)”科目。同时，按实际支付或应付的金额与上述增值税额的差额，借记“主营业务成本”等科目，并按实际支付或应付的金额，贷记“银行存款”、“应付账款”等科目。
对于期末一次性进行账务处理的企业，在期末时，应根据规定当期允许扣减销售额而减少的销项税额，借记“应交税费—应交增值税(营改增抵减的销项税额)”科目，贷记“主营业务成本”等科目。
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