当专用发票不慎遗失时，必须立即向税务机关报告并进行发票丢失备案。这一步骤是必要的，因为根据税法规定，丢失发票将导致罚款处罚。完成备案后，需要携带发票的复印件以及相应的丢失备案表格前往税务局进行认证和抵扣处理，以便正确入账。
在补办了所有必要的手续之后，企业应按照以下步骤进行账务处理：
首先，记录库存商品或原材料的成本增加；
其次，确认并记录应交税费中进项税额的增加；
最后，通过应付账款等科目反映支付给供应商的款项。
